NANCiSは国際協力分野のネットワークNGOである構成団体と、主に個別の国際協力NGOである賛同団体の参加により、組織されています。また、各分野の団体と協力することにより、効果的に活動を進めます。
◆構成団体（7団体／2024年1月1日時点）
1. 北海道NGOネットワーク協議会
2. 認定NPO法人 国際協力NGOセンター
3. 特定非営利活動法人 横浜NGOネットワーク
4. 特定非営利活動法人 名古屋NGOセンター
5. 広島NGOネットワーク
6. 特定非営利活動法人 NGO福岡ネットワーク
7. 特定非営利活動法人 沖縄NGOセンター
◆賛同団体（29団体／2024年1月1日時点）
1. 特定非営利活動法人 アーユス仏教国際協力ネットワーク
2. 公益財団法人 アジア保健研修所（AHI）
3. 公益社団法人 シャンティ国際ボランティア会
4. 認定NPO法人 地球市民の会
5. 特定非営利活動法人 チェルノブイリ救援・中部
6. 一般社団法人 SDGs市民社会ネットワーク
7. 特定非営利活動法人 シャプラニール=市民による海外協力の会
8. 公益社団法人 セーブ・ザ・チルドレン・ジャパン
9. 公益財団法人 ジョイセフ
10. オリーブジャパン国際開発協力協会
11. 特定非営利活動法人 WE21ジャパン
12. 不戦へのネットワーク
13. 特定非営利活動法人 さっぽろ自由学校「遊」
14. 非戦ネット 北海道有志の会
15. 国際子ども権利センター（シーライツ）
16. 特定非営利活動法人 NGO日本アフリカ国際開発（JANIDA）
17. 特定非営利活動法人 AMネット
18. 特定非営利活動法人 地域国際活動研究センター（CDIC）
19. 認定NPO法人 WE21ジャパンいそご
20. 認定NPO法人 日本国際ボランティアセンター
21. NGO非戦ネット
22. 特定非営利活動法人 アジア太平洋資料センター
23. 特定非営利活動法人 APLA
24. アクティブ・ミュージアム「女たちの戦争と平和資料館」（wam）
25. カンボジア市民フォーラム
26. 特定非営利活動法人 関西NGO協議会
27. 架け箸
28-29. ほか団体名非公表２団体
◆協力団体
【法曹関係】
・秘密保護法対策弁護団
・共謀罪対策弁護団
※両弁護団とは協定を結び、市民社会スペースに関わる情報交換、調査研究、政策提言で協力するとともに、市民社会スペースに関わる個別事態への法的対応にも万全を期しています。
→両弁護団との協定について
【国際関係】
・CIVICUS
・Vuka! Coalition for Civic Action
※国際的な市民社会の発展のための国際ネットワーク組織であるCIVICUS、市民社会スペースの課題に対応する国際的なネットワークであるVUKA!と協力関係を結び、国内外の市民社会スペースの課題をフォローできる体制をとっています。